Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMR0

Ankrd27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd27Q3UMR0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ankrd27Q3UMR0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ankrd27Q3UMR0 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ankrd27Q3UMR0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ankrd27Q3UMR0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ankrd27Q3UMR0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ankrd27Q3UMR0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ankrd27Q3UMR0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ankrd27Q3UMR0 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ankrd27Q3UMR0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ankrd27Q3UMR0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ankrd27Q3UMR0 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ankrd27Q3UMR0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ankrd27Q3UMR0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ankrd27Q3UMR0 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms