Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM18

Lsg1, Large subunit GTPase 1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsg1Q3UM18 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lsg1Q3UM18 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lsg1Q3UM18 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Lsg1Q3UM18 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms