Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc33Q3ULW6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms