Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E330014E10RikQ3UL33 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
E330014E10RikQ3UL33 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
E330014E10RikQ3UL33 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
E330014E10RikQ3UL33 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E330014E10RikQ3UL33 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E330014E10RikQ3UL33 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E330014E10RikQ3UL33 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E330014E10RikQ3UL33 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E330014E10RikQ3UL33 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E330014E10RikQ3UL33 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E330014E10RikQ3UL33 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E330014E10RikQ3UL33 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E330014E10RikQ3UL33 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E330014E10RikQ3UL33 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E330014E10RikQ3UL33 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
E330014E10RikQ3UL33 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E330014E10RikQ3UL33 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms