Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU4

Fam83f, Protein FAM83F, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83fQ3UKU4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms