Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKK2

Ceacam5, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5, mousemouse

Predictions only

Length 947 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam5Q3UKK2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ceacam5Q3UKK2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ceacam5Q3UKK2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ceacam5Q3UKK2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ceacam5Q3UKK2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ceacam5Q3UKK2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ceacam5Q3UKK2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ceacam5Q3UKK2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ceacam5Q3UKK2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ceacam5Q3UKK2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ceacam5Q3UKK2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ceacam5Q3UKK2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ceacam5Q3UKK2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms