Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms