Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Nkx6-3Q3UHX8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Nkx6-3Q3UHX8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Nkx6-3Q3UHX8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Nkx6-3Q3UHX8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx6-3Q3UHX8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx6-3Q3UHX8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Nkx6-3Q3UHX8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx6-3Q3UHX8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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