Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHJ8

Rnf44, RING finger protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf44Q3UHJ8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf44Q3UHJ8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms