Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI0

Ccser2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser2Q3UHI0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccser2Q3UHI0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms