Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U6N9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U6N9 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U6N9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U6N9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U6N9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U6N9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U6N9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U6N9 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U6N9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms