Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

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Length 584 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Vmn1r224-201ENSMUST00000170076 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Gm12656-201ENSMUST00000118149 577 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Fam117bQ3U3E2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Mir706-201ENSMUST00000102262 84 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Fam117bQ3U3E2 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Fam117bQ3U3E2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam117bQ3U3E2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Gm11510-201ENSMUST00000120278 347 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam117bQ3U3E2 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms