Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K0

Fam193b, Protein FAM193B, mousemouse

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam193bQ3U2K0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam193bQ3U2K0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms