Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms