Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms