Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hace1Q3U0D9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms