Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0A6

Hbq1b, Globin d1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbq1bQ3U0A6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hbq1bQ3U0A6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hbq1bQ3U0A6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Hbq1bQ3U0A6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Hbq1bQ3U0A6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Hbq1bQ3U0A6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Hbq1bQ3U0A6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Hbq1bQ3U0A6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Hbq1bQ3U0A6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Hbq1bQ3U0A6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Hbq1bQ3U0A6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Hbq1bQ3U0A6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Hbq1bQ3U0A6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hbq1bQ3U0A6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms