Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYU2

Atp13a5, Probable cation-transporting ATPase 13A5, mousemouse

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a5Q3TYU2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp13a5Q3TYU2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms