Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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