Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc136Q3TVA9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms