Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTY5

Krt2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt2Q3TTY5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms