Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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