Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms