Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc102aQ3TMW1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms