Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc10Q3TLI0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms