Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Smarca4Q3TKT4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms