Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc69Q3TCJ8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms