Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms