Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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