Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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