Protein–RNA interactions for Protein: Q148W0

Atp8b1, Phospholipid-transporting ATPase IC, mousemouse

Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b1Q148W0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Atp8b1Q148W0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Atp8b1Q148W0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Atp8b1Q148W0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Atp8b1Q148W0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Atp8b1Q148W0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Atp8b1Q148W0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Atp8b1Q148W0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Atp8b1Q148W0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b1Q148W0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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