Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms