Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vps8Q0P5W1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vps8Q0P5W1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms