Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ubxn2bQ0KL01 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms