Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnnm1Q0GA42 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms