Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

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Length 804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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