Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn3Q07409 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms