Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah2Q06986 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms