Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms