Protein–RNA interactions for Protein: Q05928

Btc, Probetacellulin, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BtcQ05928 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BtcQ05928 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
BtcQ05928 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BtcQ05928 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BtcQ05928 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BtcQ05928 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BtcQ05928 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BtcQ05928 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BtcQ05928 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BtcQ05928 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BtcQ05928 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BtcQ05928 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms