Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Apoc2Q05020 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms