Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms