Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sox12Q04890 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox12Q04890 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms