Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Top1Q04750 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Top1Q04750 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Top1Q04750 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Top1Q04750 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Top1Q04750 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Top1Q04750 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Top1Q04750 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Top1Q04750 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Top1Q04750 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Top1Q04750 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Top1Q04750 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Top1Q04750 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Top1Q04750 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms