Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms