Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnd1Q03719 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms