Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms