Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Crisp3Q03402 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Crisp3Q03402 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Crisp3Q03402 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Crisp3Q03402 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Crisp3Q03402 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Crisp3Q03402 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Crisp3Q03402 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Crisp3Q03402 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Crisp3Q03402 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms