Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms