Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms